Fushat prioritare të kërkimit në Departamentin e Hidraulikës dhe Hidroteknikës janë:
- Fusha e kerkimit në Hidraulikë
- Fusha e kerkimit në Hidrologji
- Fusha e kerkimit në Vepra Hidroteknike
- Fusha e kerkimit në Struktura Bregdetare
- Fusha e kerkimit në Mbrojtje Lumore
- Fusha e kerkimit në infrastrukturën e Transportit
